来了来了~第二期XIALAB生信培训与交流研讨会
时间:2021-03-25 阅读量:2347
是否还被困在海量的测序数据中苦苦挣扎?
来~来~来~,我们一起努力!
想在炎炎夏日感受广州的热情吗?
想品尝不一样的岭南佳果荔枝吗?
想快人一步走出生信菜鸟的怪圈吗?
想认识一帮志同道合的生信朋友吗?
想!就行动起来吧!
第二期XIALAB生信培训与交流研讨会
第一轮通知(预报名)
主办:亚热带生物资源保护与利用国家重点实验室
华南农业大学园艺学院
承办:夏瑞课题组(XIALAB)
时间:2021年7月5-11号
地点:华南农业大学校内
一、培训内容
Day 1 高通量测序基础,Linux与Python编程入门
Day 2 植物RNAseq数据分析及可视化
Day 3 植物小分子RNA数据分析
Day 4 植物DNA甲基化与BS-seq数据分析
Day 5 植物基因组组装、注释与分析策略与方法
Day 6 植物群体基因组学与遗传变异分析
Day 7 生信工具TBtools及其他相关工具使用(IGV等)
二、培训主讲
XIALAB外邀势力主讲
张兴坦,博导,中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所研究员
2009年于哈尔滨工业大学本科毕业,2015年于重庆大学获得植物学博士学位。长期致力于植物功能基因组学研究,研究领域包括复杂基因组的组装和分型、生物信息分析技术的开发、基于组学大数据挖掘重要功能基因等。研究成果以第一或通讯作者(含共同)在Cell、Nature、Nature Genetics、 Nature Plants、Nature Communications等期刊发表高水平论文多篇。
周永锋,博导,中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所研究员
2014年博士毕业于芬兰奥卢大学(University of Oulu),2014-2020年期间先后在奥卢大学与美国加州大学(University of California)从事博士后研究。主要从事作物群体基因组学与遗传育种工作,开展了水稻、葡萄等作物的驯化群体基因组学研究,揭示了作物的驯化成本,以及重要农艺性状相关的适应性变异、有害变异与结构变异。到目前为止,共发表SCI论文20多篇,其中以通讯或第一作者或通讯作者在Nature Plants、PNAS、 Molecular Biology and Evolution等杂志发表SCI论文12篇。
郭伟龙,博导,中国农业大学农学院作物基因组与生物信息学系副教授
2009年于北京邮电大学本科毕业,2014年于清华大学获工学博士学位。目前以通信作者或第一作者在Nature Communications、Molecular Plant、Nucleic Acids Research等期刊发表多篇高水平论文。长期从事生物信息学研究,具有计算机、统计、生物等多学科交叉研究背景。已开发的DNA甲基化数据比对工具BS-Seeker2和分析软件包CGmapTools已被国际同行广泛使用。在作物研究方向,开发了SNP数据检索分析开源数据库模型SnpHub,并搭建了小麦属变异组学数据库Wheat-SnpHub-Portal;提出了泛基因组时代同源基因推断新策略GeneTribe,并构建第一个小麦族同源基因数据库TGT,访问量逾万次。个人主页:http://guoweilong.github.io/
XIALAB主讲
夏瑞,博导,华南农业大学园艺学院教授
美国弗吉尼亚理工大学(VIRGINIA TECH)园艺学博士。2016年6月回国到华南农业大学园艺学院工作。长期以来主要通过高通测序和生物信息数据挖掘,开展植物基因组、小分子RNA等方面研究,生物学问题主要关注无患子科果树花果发育和次生代谢产物。目前课题组已开发出一系列小RNA数据分析工具。现已在Nature Communication、Molecular Plant、 Plant Cell等国际知名学术刊物发表SCI论文40余篇。
陈程杰,华南农业大学园艺学院教师,生信工具TBtools作者、微信公众号“生信札记”运营者
现已在Molecular Plant、Nature Communications、New Phytologist、Horticulture Research等国际知名杂志发表论文10余篇。
冯筠庭,华南农业大学园艺学院夏瑞课题组在读博士
拥有扎实生信基础,熟练使用Shell、Python和R等语言并能够开发一些流程。主要从事植物基因组学分析,群体重测序与全基因组关联分等,博士期间主导荔枝基因组数据的分析。
三、报名条件
(1)申请人对生物信息数据分析有一定基础,研究课题与高通量数据分析及本次培训内容直接相关;
(2)由于培训名额有限,我们将根据申请人研究的课题背景及与培训内容的相关性进行筛选;
(3)培训人员需交纳注册费且自行负责食宿。
Early Bird(5月1日前): ¥3600元/人;5月1日后:¥3999元/人
四、报名方式
请将报名表(见文后)发送至邮箱xialab@scau.edu.cn,邮件主题请使用“报名者姓名_2021生信培训”。
在材料审核通过后,我们将通知报名成功者,并确定培训事项。
本次生信培训专为生信菜鸟打造,干货满满,技能满满,带你轻松入门,快速上手,让你收获满满!还等什么?快来报名吧!!!
2019年XIALAB第一次培训
公益开讲,圆满收官——2019 XIALAB暑期生信狂欢之旅 <<<戳这里
培训主讲亮点工作
Mol Plant | 五年磨一剑,华南农业大学夏瑞课题组发表生信小工具TBtools <<<戳这里
TBtools发布后,每天平均>1次的引用
郭伟龙老师最新MP文章-小麦同源基因组数据库 <<<戳这里
周永峰老师NP文章-葡萄驯化